Alexander Sundermann and Lee Harrison working in lab
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阻止疾病在医院传播的新方法

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通过将机器学习与全基因组测序相结合,匹兹堡大学医学院卡耐基梅隆大学与追踪传染病爆发的传统方法相比,科学家们极大地改进了在医院环境中快速检测传染病爆发的方法。

结果该球速体育研究今天发表在该杂志上临床传染病为卫生系统提供了一种方法,使其能够识别并及时制止以医院为基础的传染病暴发,从而降低成本并挽救生命。

“目前医院用来发现和阻止传染病在病人之间传播的方法已经过时了。这些做法在一个多世纪里没有明显改变,”资深作者李·哈里森(Lee Harrison)说球速体育医学院的感染性疾病教授球速体育大学公共卫生球速体育研究生院的流行病学教授. “我们的程序检测到重要的疫情,否则传统的感染预防监测就会漏掉这些疫情。”

医疗保健相关传播增强检测系统(EDS-HAT)将最近发展的经济实惠的基因组测序与计算机算法结合起来,这些算法与电子健康记录中的大量数据相连接。当测序检测到医院里任何两个或两个以上的病人有几乎相同的感染菌株时,机器学习就会迅速从这些病人的电子健康记录中挖掘共性- - - - - -无论球速体育是靠近医院病床,使用相同设备的手术还球速体育是共享医疗服务提供者- - - - - -提醒感染预防人员调查并阻止进一步传播。

通常,这一过程需要临床医生注意到两个或两个以上的患者有类似的感染,并提醒他们的感染预防小组,然后他们可以审查患者记录,试图找出感染球速体育是如何传播的。

“这球速体育是一个令人难以置信的劳动密集型过程,通常依赖于忙碌的医护人员注意到患者之间的共同感染,”主要作者亚历山大·桑德曼(Alexander Sundermann)说,他球速体育是球速体育公共卫生学院的临床球速体育研究协调员和博士生。“如果病人住在医院的同一个病房,这可能会起作用,但如果这些病人住在不同的病房,有不同的医疗团队,唯一的共享联系就球速体育是去手术室,那么在其他病人被感染之前发现疫情的可能性就会大幅下降。”

2016年11月至2018年11月,工作人员在UPMC长老会医院在继续使用实时、传统的感染预防方法的同时,对全国范围内通常与卫生保健获得性感染相关的几种选定的传染性病原体进行了EDS-HAT测试,延迟了6个月。然后,球速体育研究小组调查了新系统的运行情况。

在这两年期间,EDS-HAT检测到99个类似感染聚集,并在65.7%的聚集中确定了至少一个潜在的传播途径。在同一时期,感染预防利用全基因组测序协助调查了15起疑似疫情,其中两起发现了与遗传有关的感染。

球速体育研究小组估计,如果EDS-HAT能够实时运行,可以防止多达63例传染病从一个病人传染给另一个病人。它还将为医院节省多达692 500美元。

在另一个案例球速体育研究中,EDS-HAT追踪到了一个介入放射治疗过程中一种特殊耐药菌株的爆发这球速体育是按照制造商的说明进行的。由于新系统能够检测到疫情,UPMC提醒制造商注意导致错误灭菌操作的说明。

“在这种情况下,EDS-HAT将不同医院单位发生的看似无关的患者感染之间的点连接起来,阻止了疫情的爆发,但也有可能防止其他医院发生类似的疫情,”哈里森说。“这个例子概括了EDS-HAT的价值。”

UPMC计划在UPMC长老会医院实时引入EDS-HAT,并期望这一创新在未来有利于其他感染预防和控制最新体育赛事资讯、实时赔率分析及在线投注平台。最初的EDS-HAT主要专注于耐药细菌病原体,很快将扩展到包括COVID-19在内的呼吸道病毒的测序。

 

- - - - - - Allison Hydzik